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Même en plein cœur de l’hiver, quand la surface de l'eau est prise par une couche de glace, le bassin de jardin reste biologiquement actif. Les végétaux morts et les autres composés organiques continuent de se décomposer, libérant ainsi des gaz toxiques . Ces gaz ne pouvant pas s’échapper du bassin puisqu’ils sont prisonniers de la surface gelée, il y a un risque pour les poissons et les autres formes de vie aquatiques qui se réfugient l’hiver dans les couches plus profondes et donc plus chaudes du bassinEn effet certains d'entre eux peuvent ne pas résister dans ce cas. Le plus souvent, les poissons meurent empoisonnés par l’accumulation des gaz toxiques qui paralysent leur système respiratoire. De plus, la glace prive l’eau de tout contact avec l’air ambiant ce qui peut faire baisser dangereusement la teneur en oxygène du bassin et, par là même, causer la mort des poissons.
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